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Especialidad en Bioinformática – Enero 2025
Programa
14 secciones
84 lecciones
28 semanas
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M0 Bienvenido a la Especialidad en Bioinformática
5
1.1
Bienvenido(a) a la Especialidad en Bioinformática
1.2
Calendario de la Especialidad en Bioinformática
1.3
Criterios de evaluación
1.4
Comunicación
1.5
Sesión de Introducción al programa
M1 Introducción a la Bioinformática
6
2.1
Recursos módulo 1
2.2
Sesión 1: Conceptos biológicos y bioinformáticos
2.3
Sesión 2: Primeros pasos en la bioinformática
2.4
Sesión 3: Bases de datos
2.5
Sesión 4: Minería de genes
2.6
Entregable módulo 1
M2 Galaxy para análisis bioinformáticos
6
3.1
Recursos módulo 2
3.2
Sesión 1: Galaxy: plataforma, características y herramientas.
3.3
Sesión 2: Análisis y visualización de datos de secuenciación de transcriptomas
3.4
Sesión 3: Análisis y visualización de datos de secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina
3.5
Sesión 4: Integración de datos y menú de opciones de Galaxy
3.6
Entregable módulo 2
M3 R y R Studio para Bioinformática
7
4.1
Recursos módulo 3
4.2
Sesión 1: Introducción a la programación en R para Bioinformática
4.3
Sesión 2: Aspectos básicos de R
4.4
Sesión 3: Estructuras y filtrado de datos
4.5
Sesión 4: Trabajando con archivos biológicos
4.6
Sesión 5: Bioconductor y uso de Rstudio
4.7
Entregable módulo 3
M4 Python para Bioinformática
7
5.1
Recursos módulo 4
5.2
Sesión 1: Introducción al curso e instalación de un ambiente bioinformático para Python
5.3
Sesión 2: Análisis de datos biológicos con Python
5.4
Sesión 3: Manejando datos de expresión génica
5.5
Sesión 4: Introducción al Machine Learning
5.6
Sesión 5: Genómica funcional
5.7
Entregable módulo 4
M5 Visualización de datos Biológicos
6
6.1
Recursos módulo 5
6.2
Sesión 1: Visualización de datos biológicos con R (parte I)
6.3
Sesión 2: Visualización de datos biológicos con R (parte II)
6.4
Sesión 3: Visualización de datos con Python (parte I)
6.5
Sesión 4: Visualización de datos con Python (parte II)
6.6
Entregable módulo 5
M6 Introducción a la Bioestadística
6
7.1
Recursos módulo 6
7.2
Sesión 1: Fundamentos teóricos del análisis estadístico en genómica
7.3
Sesión 2: Pruebas de hipótesis múltiples y corrección de errores
7.4
Sesión 3: Significancia estadística versus significado biológico
7.5
Sesión 4: Distribución de Poisson y aplicación en protocolos
7.6
Entregable módulo 6
M7 Fundamentos de Unix y Linux para Bioinformática
7
8.1
Recursos módulo 7
8.2
Sesión 1: Conociendo la interfaz de línea de comandos
8.3
Sesión 2: Ejecución de programas y automatización de procesos
8.4
Sesión 3: Administración de un sistema Linux orientado a bioinformática
8.5
Sesión 4: La caja de herramientas del bioinformático en Linux
8.6
Sesión 5: Temas avanzados y consolidación de dudas
8.7
Entregable módulo 7
M8 Secuenciación y ensamble genómico
6
9.1
Recursos módulo 8
9.2
Sesión 1: Fundamentos de los métodos de secuenciación, estrategias de ensamble y manejo de datos genómicos.
9.3
Sesión 2: Evaluación de la calidad de los datos de secuenciación y preprocesamiento
9.4
Sesión 3: Ensamblaje genómico
9.5
Sesión 4: Evaluación de la calidad del ensamblaje y anotación básica
9.6
Entregable módulo 8
M9 RNA-Sequencing y análisis comparativos
7
10.1
Recursos módulo 9
10.2
Sesión 1: Fundamento del ensayo de RNA-seq
10.3
Sesión 2: Herramientas para el análisis de datos de RNA-seq (I)
10.4
Sesión 3: Herramientas para el análisis de datos de RNA-seq (II)
10.5
Sesión 4: Herramientas para el análisis de datos de RNA-seq (III)
10.6
Sesión 5: Visualización de los datos procesados del RNA-seq
10.7
Entregable módulo 9
M10 Bioinformática para el análisis de célula única (Single Cell Analysis)
7
11.1
Recursos módulo 10
11.2
Sesión 1: Introducción a las tecnologías de single cell y procesamiento de la muestras
11.3
Sesión 2: Generación de la matriz de conteos y preprocesamiento de los datos
11.4
Sesión 3: Análisis de los datos y caracterización de las poblaciones celulares
11.5
Sesión 4: Visualización e interpretación de datos
11.6
Sesión 5: Bases de datos de single cell RNA-seq y perspectivas: ¿Qué hay después del análisis?
11.7
Entregable módulo 10
M11 Interpretación de datos Biológicos
6
12.1
Recursos módulo 11
12.2
Sesión 1: Diseño experimental
12.3
Sesión 2: Aplicación de herramientas bioinformáticas
12.4
Sesión 3: Elección y diseño de gráficas y tablas
12.5
Sesión 4: Construcción de una narrativa y presentación del proyecto
12.6
Entregable módulo 11
M12 Fundamentos de Bioinformática Estructural
7
13.1
Recursos módulo 12
13.2
Sesión 1: Introducción a la bioinformática estructural
13.3
Sesión 2: Análisis de estructuras proteicas
13.4
Sesión 3: Modelado estructural de proteínas.
13.5
Sesión 4: Validación de estructuras y métodos de refinamiento.
13.6
Sesión 5: Análisis de interacciones proteína-ligando.
13.7
Entregable módulo 12
Graduación Especialidad en Bioinformática
1
14.1
Graduación Especialidad en Bioinformática Enero – Junio 2025
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Brida Furiate
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