Curso de Identificación Taxonómica Basada en Genomas

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tecnológico de Monterrey

Curso de Identificación Taxonómica Basada en Genomas

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Como investigador, enfrentarte a datos genómicos sin un método claro para interpretarlos puede frenar el avance de tu proyecto. Este curso te enseña a identificar y clasificar bacterias a partir de genomas completos, usando herramientas bioinformáticas y bases de datos de referencia. Aprenderás a comparar genomas con ANI y dDDH, construir filogenias robustas y aplicar criterios modernos para la descripción de nuevas especies, generando resultados confiables y publicables.

Qué aprenderás

Interpretación filogenética crítica

Análisis bioinformático aplicado a la taxonomía

Selección de métodos de identificación genómica

A quién va dirigido este curso

Este curso está dirigido a investigadores, profesores y estudiantes de ciencias biológicas y de la salud que deseen adquirir habilidades en la identificación y clasificación de bacterias mediante herramientas bioinformáticas. También es apto para cualquier persona con interés general en microbiología y taxonomía bacteriana que quiera aprender sobre el tema de forma accesible.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Introducción a la comparación genómica

Concepto de identidad genómica y su relevancia en taxonomía.
ANI (Average Nucleotide Identity): fundamentos y umbrales de especie. Herramientas para cálculo de ANI (OrthoANI, FastANI).
Ejemplo práctico de cálculo de ANI entre genomas de referencia.
Práctica 1: Uso de FastANI y OrthoANI para comparar un genoma desconocido con genomas de referencia.

M2 Métodos de comparación avanzada

dDDH (digital DNA-DNA Hybridization): principio y relación con ANI.
Herramienta GGDC y su interpretación Mash: estimadores rápidos de distancia genómica.
Fundamentos del uso del 16S rRNA en identificación bacteriana.
Práctica 2: Exploración del servidor GGDC para calcular dDDH y contrastarán los resultados con ANI.

M3 Filogenia basada en genomas completos

Diferencias entre filogenia con 16S rRNA y filogenomas.
Métodos de filogenia: Árboles de genes concatenados (core genome).
Árboles de genomas completos.
Herramientas comunes: PhyloPhlAn, GTDB-Tk, IQ-TREE.
Práctica 3: Uso de GTDB-Tk o PhyloPhlAn para generar filogenias.

M4 Criterios modernos para nuevas especies

Umbrales taxonómicos: ANI, dDDH, AAI.GTDB (Genome Taxonomy Database): estructura y aplicaciones.
TYGS (Type Strain Genome Server): comparación con cepas tipo.
Pasos para la propuesta de una nueva especie.
Práctica 4: Exploración de TYGS para análisis de genomas.

M5 Casos reales y discusión crítica

Ejemplos de reclasificación taxonómica con genomas completos: Streptomyces, Bacillus, Pseudomonas.
Análisis de artículos recientes sobre cambios taxonómicos.
Implicaciones de la reclasificación para salud, ecología y biotecnología.
Integración del proyecto final: presentación de resultados y conclusiones.
Práctica 5: Presentación de resultados (comparativa de identificación).

Proyecto

Explorando la taxonomía basada en genomas completos

Aplicarás métodos de comparación genómica, filogenia de genomas completos y criterios modernos de clasificación bacteriana (GTDB, TYGS) para determinar la identidad taxonómica de un conjunto de genomas y evaluar si corresponde a una especie descrita o potencialmente nueva.

Instructor

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tecnológico de Monterrey

Bióloga con maestría en biotecnología y doctoranda en el Tecnológico de Monterrey (2024). Su investigación se centra en la genómica comparativa, clonación modular y expresión heteróloga en Streptomyces, explorando la diversidad química de actinobacterias aisladas de entornos poco estudiados. Ha realizado estancias en CENIBiot-CONARE (Costa Rica, 2024) y la Universidad de Oviedo (España, 2023), especializándose en HPLC-MS/MS y ensamblaje de clústeres biosintéticos. Ha publicado en revistas científicas y presentado su trabajo en congresos internacionales, como la ISBA Conference (Canadá, 2022), además de ser seleccionada para el Summer School on Applied Molecular Microbiology (John Innes Centre, Croacia, 2024).

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Fundamentos de biología y genética.
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Introducción a la comparación genómica

Concepto de identidad genómica y su relevancia en taxonomía.
ANI (Average Nucleotide Identity): fundamentos y umbrales de especie. Herramientas para cálculo de ANI (OrthoANI, FastANI).
Ejemplo práctico de cálculo de ANI entre genomas de referencia.
Práctica 1: Uso de FastANI y OrthoANI para comparar un genoma desconocido con genomas de referencia.

M2 Métodos de comparación avanzada

dDDH (digital DNA-DNA Hybridization): principio y relación con ANI.
Herramienta GGDC y su interpretación Mash: estimadores rápidos de distancia genómica.
Fundamentos del uso del 16S rRNA en identificación bacteriana.
Práctica 2: Exploración del servidor GGDC para calcular dDDH y contrastarán los resultados con ANI.

M3 Filogenia basada en genomas completos

Diferencias entre filogenia con 16S rRNA y filogenomas.
Métodos de filogenia: Árboles de genes concatenados (core genome).
Árboles de genomas completos.
Herramientas comunes: PhyloPhlAn, GTDB-Tk, IQ-TREE.
Práctica 3: Uso de GTDB-Tk o PhyloPhlAn para generar filogenias.

M4 Criterios modernos para nuevas especies

Umbrales taxonómicos: ANI, dDDH, AAI.GTDB (Genome Taxonomy Database): estructura y aplicaciones.
TYGS (Type Strain Genome Server): comparación con cepas tipo.
Pasos para la propuesta de una nueva especie.
Práctica 4: Exploración de TYGS para análisis de genomas.

M5 Casos reales y discusión crítica

Ejemplos de reclasificación taxonómica con genomas completos: Streptomyces, Bacillus, Pseudomonas.
Análisis de artículos recientes sobre cambios taxonómicos.
Implicaciones de la reclasificación para salud, ecología y biotecnología.
Integración del proyecto final: presentación de resultados y conclusiones.
Práctica 5: Presentación de resultados (comparativa de identificación).