Curso de Galaxy y herramientas no code para bioinformática

Dr. Hober Nelson Núñez Martínez

Universidad Nacional Autónoma de México Universidad Nacional Autónoma de México

Curso de Galaxy y herramientas no code para bioinformática

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Galaxy es una plataforma gratuita compuesta por una colección de herramientas para el análisis de datos biológicos, principalmente para datos genómicos, con la finalidad de facilitar su procesamiento y visualización sin la necesidad de conocimientos avanzados de programación o de línea de comandos y desde la comodidad de una PC.

Qué aprenderás

Importación de datos en Galaxy

Manipulación de datos de secuenciación masiva

Visualización e interpretación de los datos

A quién va dirigido este curso

Este curso está enfocado a estudiantes, profesionales e investigadores de las áreas biológicas con conocimientos relacionados en los campos de biología molecular, genómica y epigenómica interesados en el aprendizaje del manejo de la plataforma de Galaxy para el análisis de datos biológicos provenientes de ensayos basados en secuenciación masiva.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Galaxy: plataforma y características

Características de Galaxy: ventajas y desventajas.

Práctica 1: obtención de una cuenta en Galaxy.

Interfaz de Galaxy: menú, herramientas, historias y área de trabajo.

Repositorios de datos: GEO y EBI.
Práctica 2: importación de datos.

M2 Análisis de calidad y procesamiento de datos

Fundamento: ensayo de ChIP-seq.
Práctica 3: análisis de calidad de los datos.

Práctica 4: mapeo y análisis de calidad.

Práctica 5: filtrado de datos.
Práctica 6: llamado de picos.

M3 Visualización y anotación funcional

Práctica 7: normalización y generación de señal.

Práctica 8: visualización.

Práctica 9: anotación de picos.
Práctica 10: análisis de motivos de unión.

M4 Integración de datos

Integración de datos ómicos: importancia funcional.

Práctica 11: integración de datos de ATAC-seq.

Práctica 12: integración de datos de RNA-seq.

Práctica 13: visualización de los datos

M5 Menú de opciones de Galaxy

Práctica 14: eliminar y copiar historias.

Práctica 15: compartir y descargar historias.

Práctica 16: diagramas de flujo.
Práctica 17: Galaxy training.

Proyecto

Identificación de genes regulados por factores de transcripción durante la diferenciación eritroide humana.

Utilizando las herramientas de Galaxy, se desarrollará el flujo de trabajo para identificar, integrar y visualizar genes regulados por factores de transcripción durante la diferenciación eritroide humana.

Instructor

Dr. Hober Nelson Núñez Martínez

Universidad Nacional Autónoma de México

Doctor en Ciencias Biomédicas. Ha participado en la aplicación de metodologías experimentales y computacionales en diversos modelos biológicos. Actualmente se especializa en la aplicación de herramientas de edición genética y ómicas para el estudio de los mecanismos regulatorios que influyen en los patrones de expresión génica durante la diferenciación celular.

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Conceptos básicos de biología molecular, genómica y computación.
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Galaxy: plataforma y características

Características de Galaxy: ventajas y desventajas.

Práctica 1: obtención de una cuenta en Galaxy.

Interfaz de Galaxy: menú, herramientas, historias y área de trabajo.

Repositorios de datos: GEO y EBI.
Práctica 2: importación de datos.

M2 Análisis de calidad y procesamiento de datos

Fundamento: ensayo de ChIP-seq.

Práctica 3: análisis de calidad de los datos.

Práctica 4: mapeo y análisis de calidad.

Práctica 5: filtrado de datos.
Práctica 6: llamado de picos.

M3 Visualización y anotación funcional

Práctica 7: normalización y generación de señal.

Práctica 8: visualización.

Práctica 9: anotación de picos.
Práctica 10: análisis de motivos de unión.

M4 Integración de datos

Integración de datos ómicos: importancia funcional.

Práctica 11: integración de datos de ATAC-seq.

Práctica 12: integración de datos de RNA-seq.
Práctica 13: visualización de los datos

M5 Menú de opciones de Galaxy

Práctica 14: eliminar y copiar historias.

Práctica 15: compartir y descargar historias.

Práctica 16: diagramas de flujo.
Práctica 17: Galaxy training.