Curso de Docking Molecular para moléculas pequeñas

PhD(c). César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana

Curso de Docking Molecular para moléculas pequeñas

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

En este curso práctico te introducirás al flujo esencial para la ejecución de análisis de biomoléculas usando el Docking Molecular.

Al finalizar, podrás diseñar y ejecutar un flujo básico para una diana proteína–ligando, establecer criterios de calidad, interpretar y priorizar resultados, y documentar tus hallazgos en un informe breve reutilizable para tu investigación o portafolio de proyectos.

Qué aprenderás

Uso de software especializado para Docking Molecular

Visualización y análisis de complejos proteína-ligando

Ejecución de Docking molecular de calidad

A quién va dirigido este curso

Este curso está dirigido a investigadores, estudiantes de posgrado y profesionales en bioquímica, biotecnología, química computacional y disciplinas afines que deseen comprender y aplicar metodologías de acoplamiento molecular en el estudio de interacciones proteína-ligando. Está diseñado tanto para principiantes que buscan una introducción teórica y práctica a las herramientas de docking como para aquellos con experiencia previa que desean optimizar sus estrategias de simulación y análisis de resultados en el diseño de fármacos, biocatálisis o biotecnología.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Introducción al Docking molecular

Fundamentos del docking molecular.
Revisión de casos de éxito de Docking.
Bases de datos utilizadas en el docking molecular.
Software para Docking Molecular

Práctica 1:

Instalación del software para Docking Molecular.
- Chimera UCF.
- Autodock Vina.
- WSL.
- Discovery studio.
- Conda.

M2 Docking simple para moléculas orgánicas pequeñas

Consideraciones previas y flujo general para la ejecución de un Docking Molecular de calidad.
Obtención de un complejo proteína-ligando mediante docking molecular.

Práctica 2:

Obtención y preparación de estructuras de proteínas para el docking molecular.
Obtención y preparación de ligandos para Docking Molecular.

M3 Análisis de resultados del docking sencillo

Limitaciones y alcances del docking molecular.
Docking flexible.

Práctica 3:

Generación de diagramas 2D de interacción con servidores en línea.
Análisis de la interacción con Quimera UCF
Análisis de la interacción con otras herramientas.
Características e instalación de WSL y open babel.

M4 Cribado virtual y preparación de ligandos.

¿Qué es un cribado virtual?
Casos de éxitos utilizando el cribado virtual para identificar moléculas con un efecto deseado.

Práctica 4:

Búsqueda y obtención de una quimioteca.
Construcción de una quimióteca.
Preparación de una quimióteca con open babel y RDkit.

M5 Aplicaciones del cribado virtual: Ejecución y análisis.

Aplicación de cribado virtual en otras áreas, casos de éxito y oportunidad.

Práctica 5

Preparación de la proteína.
Selección del sitio de unión con descriptores de superficie.
Otras estrategias para la selección de sitios para el cribado.
Ejecución del cribado virtual.

Proyecto

Descripción de una interacción proteína ligando.

Utilizando el flujo de trabajo aprendido durante este curso para ejecutar simulaciones de docking molecular, obtendrás un complejo proteína-ligando que posteriormente se analizará con herramientas especializadas.

Instructor

PhD(c). César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana unidad Iztapalapa.

Maestro en Ciencias y Estudiante de Doctorado (en Química), formado en el área de biofisicoquímica. Su campo de investigación es la fisicoquímica de proteínas y el diseño racional de fármacos. Tiene experiencia en el manejo de técnicas experimentales como: Fluorescencia, espectroscopia UV-vis, Dicroísmo Circular, Calorimetría de titulación isotérmica y Dispersión Dinámica de Luz. Además de técnicas computacionales y bioinformáticas como el modelado por homología, Docking y Dinámica Molecular.

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Conocimientos básicos de bioquímica o química orgánica
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas