Curso de Anotación de genomas microbianos

Dr. Edder Daniel Bustos Díaz

Naturalis Biodiversity Center

Curso de Anotación de genomas microbianos

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Este curso está diseñado para investigadores y científicos interesados en aprender a hacer anotación de genomas microbianos. A lo largo del programa, los participantes explorarán conceptos clave sobre la anotación funcional y estructural de genomas, desarrollarán habilidades prácticas para hacer y analizar anotación de genomas.

Qué aprenderás

Identificación de los componentes de un genoma

Anotación de genomas microbianos

Interpretación de datos genómicos

A quién va dirigido este curso

Este curso está diseñado para investigadores, estudiantes de posgrado, bioinformáticos y profesionales de ciencias biológicas que deseen adquirir competencias en análisis y anotación de genomas. Es especialmente útil para quienes trabajan con datos de secuenciación, buscan interpretar información genómica y aplicar herramientas computacionales para la caracterización de genes y regiones funcionales en diferentes organismos. No se requiere experiencia avanzada en programación, aunque conocimientos básicos de biología molecular y genética serán de ayuda para un mejor aprovechamiento del curso.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Componentes estructurales de un genoma microbiano

El cromosoma bacteriano: Comprensión de los componentes estructurales de un genoma microbiano.
Plásmidos y otros elementos móviles: Comprensión de los diferentes elementos móviles dentro de un genoma microbiano.
Elementos funcionales de un genoma: Comprensión de los diferentes elementos
funcionales que se encuentran en un genoma microbiano.
Navegación en la página de genomas de NCBI.
Práctica 1: Descarga del cromosoma de un genoma bacteriano.

M2 Anotación funcional de un genoma bacteriano

Conceptos básicos en anotación de genomas
Flujo de trabajo de un anotador de genomas: Comprensión de los pasos que se requieren para la anotación de genomas microbianos.
Estrategias para la anotación funcional: Comprensión de las diferentes estrategias bioinformáticas usadas para la anotación funcional.
Herramientas de anotación: Comprensión de las diferencias y similitudes de las diferentes herramientas de anotación de genomas.
Práctica 2: Anotación funcional del genoma bacteriano con RAST y Prokka.

M3 Exploración de los resultados de la anotación

Formatos de archivos de anotación: Comprensión de los diferentes tipos y
formatos de archivos de anotación.
Exploración de archivos de salida de RAST.
Exploración de archivos de salida de Prokka.
Práctica 3: Descarga y exploración de archivos de salida (RAST, Prokka y PGAP)

M4 Validación de los resultados de anotación

Comparativa entre anotadores: Comprensión de métricas usadas para comparar los resultados de los diferentes anotadores.
Revisión de calidad: Implementación de estrategias para detección de errores de anotación.
Busqueda de genes de interes: Uso de herramientas bioinformáticas para la búsqueda e identificación de genes de interés.
Práctica 4: Identificación y validación de genes de interés.

M5 Exploración de regiones de interés

Identificación de regiones de interés: Implementación de métricas para la
identificación de regiones de interés en el genoma (islas genómicas).
Identificación de operones: Delimitación de operones en la región de interés
Práctica 5: Búsqueda e identificación de islas genómicas.
Revisión de proyectos y retroalimentación

Proyecto

Anotación e identificación de genes de simbiosis en una isla genómica

Te familiarizarás con el uso de herramientas bioinformáticas en línea para la anotación funcional de genomas, realizando la anotación del genoma de una bacteria capaz de establecer simbiosis con plantas. Asimismo, aprenderás a identificar genes y regiones de interés, así como las principales herramientas empleadas para estos análisis.

Instructor

Dr. Edder Daniel Bustos Díaz

Naturalis Biodiversity Center

Doctor en Biología Integrativa (CINVESTAV), con formación especializada en microbiología y bioinformática. Su trabajo se enfoca en el estudio de comunidades bacterianas mediante enfoques de genómica microbiana, incluyendo metagenómica, metataxonomía y metabolómica. Ha desarrollado pipelines de análisis de datos y experimentos con comunidades bacterianas sintéticas para el estudio de metabolitos por HPLC-MS/MS. Su experiencia combina investigación experimental y computacional para comprender la diversidad microbiana desde una perspectiva funcional y evolutiva.

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Fundamentos de genómica y biología molecular.
Conocimiento general del formato FASTA
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Componentes estructurales de un genoma microbiano

El cromosoma bacteriano: Comprensión de los componentes estructurales de un genoma microbiano.
Plásmidos y otros elementos móviles: Comprensión de los diferentes elementos móviles dentro de un genoma microbiano.
Elementos funcionales de un genoma: Comprensión de los diferentes elementos
funcionales que se encuentran en un genoma microbiano.
Navegación en la página de genomas de NCBI.
Práctica 1: Descarga del cromosoma de un genoma bacteriano.

M2 Anotación funcional de un genoma bacteriano

Conceptos básicos en anotación de genomas
Flujo de trabajo de un anotador de genomas: Comprensión de los pasos que se requieren para la anotación de genomas microbianos.
Estrategias para la anotación funcional: Comprensión de las diferentes estrategias bioinformáticas usadas para la anotación funcional.
Herramientas de anotación: Comprensión de las diferencias y similitudes de las diferentes herramientas de anotación de genomas.
Práctica 2: Anotación funcional del genoma bacteriano con RAST y Prokka.

M3 Exploración de los resultados de la anotación

Formatos de archivos de anotación: Comprensión de los diferentes tipos y
formatos de archivos de anotación.
Exploración de archivos de salida de RAST.
Exploración de archivos de salida de Prokka.
Práctica 3: Descarga y exploración de archivos de salida (RAST, Prokka y PGAP)

M4 Validación de los resultados de anotación

Comparativa entre anotadores: Comprensión de métricas usadas para comparar los resultados de los diferentes anotadores.
Revisión de calidad: Implementación de estrategias para detección de errores de anotación.
Busqueda de genes de interes: Uso de herramientas bioinformáticas para la búsqueda e identificación de genes de interés.
Práctica 4: Identificación y validación de genes de interés.

M5 Exploración de regiones de interés

Identificación de regiones de interés: Implementación de métricas para la
identificación de regiones de interés en el genoma (islas genómicas).
Identificación de operones: Delimitación de operones en la región de interés
Práctica 5: Búsqueda e identificación de islas genómicas.
Revisión de proyectos y retroalimentación