Curso de Análisis filogenético de microorganismos

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tecnológico de Monterrey

Curso de Análisis filogenético de microorganismos

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Este curso está diseñado para introducir a estudiantes, docentes e investigadores en las herramientas modernas para la identificación y clasificación de bacterias mediante análisis filogenético y genómico. A lo largo de cinco días, los participantes aprenderán desde los fundamentos evolutivos hasta la construcción e interpretación de árboles filogenéticos utilizando secuencias del gen 16S rRNA y genomas completos.

Qué aprenderás

Construcción de árboles filogenéticos

Análisis taxonómico con herramientas genómicas

Interpretación de filogenias

A quién va dirigido este curso

Este curso está diseñado para investigadores, docentes y estudiantes de las áreas de ciencias biológicas y de la salud que deseen adquirir habilidades en filogenia bacteriana y clasificación microbiana mediante el uso de herramientas bioinformáticas. También es ideal para personas interesadas en microbiología evolutiva y taxonomía genómica que busquen una introducción práctica y accesible a estos temas. De esta manera, el curso integra teoría y práctica para ofrecer una formación sólida en los métodos actuales de clasificación e interpretación evolutiva de bacterias.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Fundamentos de la filogenia y evolución bacteriana

¿Qué es la filogenia? Importancia en microbiología.
Concepto de ancestro común, evolución divergente y convergente.
Diferencias entre árboles genealógicos y filogenéticos.
Características evolutivas de bacterias: reproducción clonal, transferencia horizontal de genes (HGT).
Introducción a genes marcadores: 16S rRNA, housekeeping genes.
Práctica 1: Selección de datos (entre 5–10 secuencias) de genes o genomas.

M2 Alineamiento múltiple de secuencias y limpieza

Alinear secuencias y preparar datos para la construcción de filogenias.
Herramientas de alineamiento (Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT).
Criterios de calidad del alineamiento.
Recorte de extremos, eliminación de regiones ambiguas (con AliView o TrimAl).
Práctica 2: Alineamiento de secuencias usando MAFFT o Clustal Omega.

M3 Construcción de árboles filogenéticos

Generación de árboles con diferentes algoritmos y evaluar su robustez.
Algoritmos: NJ, ML, Bayesianos.
IQ-TREE, FastTree, RAxML, MrBayes.
Bootstrap y medidas de soporte.
Formatos de árbol (Newick) y visualización (iTOL, FigTree).
Práctica 3: Construcción de filogenias con IQ-TREE (método ML). Visualización del árbol en iTOL o FigTree.

M4 Comparar diferentes métodos de inferencia filogenética

Usar al menos dos algoritmos distintos (por ejemplo, ML con IQ-TREE y NJ con FastTree).
Evaluar diferencias en la topología del árbol.
Discutir qué método ofrece mejor soporte (bootstrap, ramas, agrupamientos).
Aplicar ANI, dDDH o usar GTDB-Tk para comparar clasificación con filogenias.
Práctica 4: Creación de árboles alternativos con FastTree (NJ). Comparaciones topologías y soporte (ej. bootstrap).

M5 Pipeline completo y estudio de casos

Pipeline completo: secuencia → alineamiento → árbol → interpretación.
Casos reales: taxonomía de nuevos aislados, filogenia de patógenos y filogenia ambiental.
Discusión de errores comunes y cómo evitarlos.
Práctica 5: Presentación con 1 o 2 diapositivas con herramientas utilizadas, conclusiones y comentarios.

Proyecto

Reconstrucción filogenética de bacterias ambientales

Los participantes realizarán el análisis filogenético de un conjunto de secuencias bacterianas reales (por ejemplo, genes 16S rRNA o genomas parciales). A lo largo del curso, aplicarán los conocimientos y herramientas vistas en clase para construir, visualizar e interpretar un árbol filogenético, con énfasis en la calidad del alineamiento, el método de inferencia y la
interpretación biológica.

Instructor

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tecnológico de Monterrey

Bióloga con maestría en biotecnología y doctoranda en el Tecnológico de Monterrey (2024). Su investigación se centra en la genómica comparativa, clonación modular y expresión heteróloga en Streptomyces, explorando la diversidad química de actinobacterias aisladas de entornos poco estudiados. Ha realizado estancias en CENIBiot-CONARE (Costa Rica, 2024) y la Universidad de Oviedo (España, 2023), especializándose en HPLC-MS/MS y ensamblaje de clústeres biosintéticos. Ha publicado en revistas científicas y presentado su trabajo en congresos internacionales, como la ISBA Conference (Canadá, 2022), además de ser seleccionada para el Summer School on Applied Molecular Microbiology (John Innes Centre, Croacia, 2024).

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Fundamentos de Bioinformática estructural (Docking, dinámica y visualización de biomoléculas).
Bioquímica básica.
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Fundamentos de la filogenia y evolución bacteriana

¿Qué es la filogenia? Importancia en microbiología.
Concepto de ancestro común, evolución divergente y convergente.
Diferencias entre árboles genealógicos y filogenéticos.
Características evolutivas de bacterias: reproducción clonal, transferencia horizontal de genes (HGT).
Introducción a genes marcadores: 16S rRNA, housekeeping genes.
Práctica 1: Selección de datos (entre 5–10 secuencias) de genes o genomas.

M2 Alineamiento múltiple de secuencias y limpieza

Alinear secuencias y preparar datos para la construcción de filogenias.
Herramientas de alineamiento (Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT).
Criterios de calidad del alineamiento.
Recorte de extremos, eliminación de regiones ambiguas (con AliView o TrimAl).
Práctica 2: Alineamiento de secuencias usando MAFFT o Clustal Omega.

M3 Construcción de árboles filogenéticos

Generación de árboles con diferentes algoritmos y evaluar su robustez.
Algoritmos: NJ, ML, Bayesianos.
IQ-TREE, FastTree, RAxML, MrBayes.
Bootstrap y medidas de soporte.
Formatos de árbol (Newick) y visualización (iTOL, FigTree).
Práctica 3: Construcción de filogenias con IQ-TREE (método ML). Visualización del árbol en iTOL o FigTree.

M4 Comparar diferentes métodos de inferencia filogenética

Usar al menos dos algoritmos distintos (por ejemplo, ML con IQ-TREE y NJ con FastTree).
Evaluar diferencias en la topología del árbol.
Discutir qué método ofrece mejor soporte (bootstrap, ramas, agrupamientos).
Aplicar ANI, dDDH o usar GTDB-Tk para comparar clasificación con filogenias.
Práctica 4: Creación de árboles alternativos con FastTree (NJ). Comparaciones topologías y soporte (ej. bootstrap).

M5 Pipeline completo y estudio de casos

Pipeline completo: secuencia → alineamiento → árbol → interpretación.
Casos reales: taxonomía de nuevos aislados, filogenia de patógenos y filogenia ambiental.
Discusión de errores comunes y cómo evitarlos.
Práctica 5: Presentación con 1 o 2 diapositivas con herramientas utilizadas, conclusiones y comentarios.