Curso de metagenómica

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tec de Monterrey

Curso de metagenómica

Modalidad en video a tu ritmo

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 ($45 USD)

Información general

Este curso introduce los principios esenciales de la metagenómica y su aplicación en el estudio de comunidades microbianas complejas. A través de herramientas en línea como MG–RAST, Nephele, y MicrobiomeAnalyst, los participantes aprenderán a diseñar experimentos, procesar datos de amplicón y shotgun, analizar diversidad microbiana y explorar genomas metagenómicos (MAGs).

Qué aprenderás

Procesar datos metagenómicos con herramientas en línea

Analizar diversidad y estructura de comunidades microbianas

Reconstruir y evaluar genomas metagenómicos (MAGs)

A quién va dirigido este curso

Este curso está dirigido a estudiantes de posgrado, investigadores y profesionales en microbiología, bioinformática, ecología o biotecnología que busquen dominar el análisis de comunidades microbianas mediante herramientas prácticas en línea. Ideal para quienes deseen aprender a procesar datos metagenómicos (amplicón y shotgun), analizar diversidad microbiana, reconstruir genomas (MAGs) y aplicar estos conocimientos en proyectos reales, sin necesidad de experiencia previa en programación.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Diseño experimental y fundamentos de metagenómica

Metagenómica de amplicón vs shotgun
Diseño de muestreo, controles y metadatos
Plataformas de secuenciación

M2 Procesamiento en la metagenómica de amplicón (Nephele)

Preprocesamiento: trimming, filtrado y eliminación de quimeras
OTUs vs ASVs
Asignación taxonómica y bases de datos (SILVA, Greengenes, UNITE)

M3 Diversidad microbiana y análisis ecológico (MicrobiomeAnalyst)

Diversidad alfa: riqueza, índice de Shannon
Diversidad beta: Bray-Curtis, UniFrac, PCoA
Visualización de composición y pruebas estadística

M4 Metagenómica Shotgun: QC, ensamblaje y taxonomía

Control de calidad de lecturas (FastQC, Cutadapt)
Ensamblaje metagenómico (MEGAHIT, MetaSPAdes)
Clasificación taxonómica con Kraken2 y visualización con Krona

M5 Reconstrucción y análisis de MAGs y perfil funcional

Binning de contigs (MetaBAT2) y calidad de MAGs (CheckM)
Anotación de MAGs y principios de MAGs
Perfil funcional de comunidades con HUMAnN (pathways y gene families)
Exploración de resultados finales

Proyecto

Exploración metagenómica en línea

Este proyecto permite al estudiante recorrer los diferentes flujos de análisis metagenómico sin necesidad de instalaciones previas. De esta manera el estudiante conocerá metodologías reales para caracterizar comunidades microbianas de forma sencilla y exploratoria.

Instructor

Dra. Luz Ángela González Salazar

Tec de Monterrey

Bióloga con maestría en biotecnología y doctoranda en el Tecnológico de Monterrey (2024). Su investigación se centra en la genómica comparativa, clonación modular y expresión heteróloga en Streptomyces, explorando la diversidad química de actinobacterias aisladas de entornos poco estudiados. Ha realizado estancias en CENIBiot-CONARE (Costa Rica, 2024) y la Universidad de Oviedo (España, 2023), especializándose en HPLC-MS/MS y ensamblaje de clústeres biosintéticos. Ha publicado en revistas científicas y presentado su trabajo en congresos internacionales, como la ISBA Conference (Canadá, 2022), además de ser seleccionada para el Summer School on Applied Molecular Microbiology (John Innes Centre, Croacia, 2024).

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Conocimientos básicos de bioquímica o química orgánica
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Diseño experimental y fundamentos de metagenómica

Metagenómica de amplicón vs shotgun
Diseño de muestreo, controles y metadatos
Plataformas de secuenciación

M2 Procesamiento en la metagenómica de amplicón (Nephele)

Preprocesamiento: trimming, filtrado y eliminación de quimeras
OTUs vs ASVs
Asignación taxonómica y bases de datos (SILVA, Greengenes, UNITE)

M3 Diversidad microbiana y análisis ecológico (MicrobiomeAnalyst)

Diversidad alfa: riqueza, índice de Shannon
Diversidad beta: Bray-Curtis, UniFrac, PCoA
Visualización de composición y pruebas estadísticas

M4 Metagenómica Shotgun: QC, ensamblaje y taxonomía

Control de calidad de lecturas (FastQC, Cutadapt)
Ensamblaje metagenómico (MEGAHIT, MetaSPAdes)
Clasificación taxonómica con Kraken2 y visualización con Krona

M5 Reconstrucción y análisis de MAGs y perfil funcional

Binning de contigs (MetaBAT2) y calidad de MAGs (CheckM)
Anotación de MAGs y principios de MAGs
Perfil funcional de comunidades con HUMAnN (pathways y gene families)
Exploración de resultados finales