Curso de Dinámica molecular para moléculas complejas

PhD (c) César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana

Curso de Dinámica molecular para moléculas complejas

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Este curso te introducirá en los fundamentos teóricos y prácticos de la Dinámica Molecular (DM) para proteínas de membrana y casos de aplicación más específicos. A lo largo del mismo, aprenderás a utilizar software especializado ejecutar y analizar simulaciones, explorando parámetros clave y herramientas de visualización (VMD).

Qué aprenderás

Manejo de visualizadores moleculares.

Manejo de CHARMM-GUI.

Uso de gromacs para ejecución de simulaciones.

A quién va dirigido este curso

Este curso está dirigido a estudiantes e investigadores interesados en el modelado molecular y las simulaciones computacionales, especialmente en el área de las ciencias químico-biológicas.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Introducción e instalación de software

Análisis de los fundamentos y conceptos más importantes en el campo de la simulación y la dinámica molecular.
Análisis del primer caso de estudio del Docking molecular para moléculas orgánicas complejas.

Práctica 1: Instalación de gromacs versión 2013 para poder realizar la ejecución de las simulaciones

M2 Simulaciones con solvente mezclado

Descubre la utilidad de las simulaciones con solvente mezclado.
Arma sistemas de simulación con solvente mezclado para la evaluación de sitios de unión.

Práctica 2: Durante la sesión emplearemos herramienta en línea y módulos de gromacs para construir el sistema de interés.

M3 Simulaciones de solvente mezclado parte II

SILCS: Dinámica molecular aplicada a la identificación de sitio de unión.
Análisis del flujo SILCS para el análisis de simulaciones de solvente mezclado.
Análisis del sistema con VMD y script de Python.

Práctica 3: Identificación de sitios de unión a ligando viables.

M4 Simulaciones de proteína de membrana parte I

Particularidades de las simulaciones con proteínas de membrana.
Análisis de las diferencias y retos de las simulaciones con proteínas de membrana.
Casos de éxito y aplicación de este tipo de simulaciones.

Práctica 4: Construcción un sistema de simulaciones de proteína de membrana mediante el servidor en línea CHARMM-GUI.

M5 Simulaciones de proteína de membrana parte II.

Análisis de las propiedades de las proteínas que se presentan comúnmente.
Explora los análisis más complejos de las simulaciones de proteína de membrana

Práctica 5: Análisis de los resultados de las simulaciones de proteína de membrana.

Proyecto

Simulación de una proteína de membrana en solución

Mediante el uso de visualizadores moleculares realizarás un sistema de simulación con una proteína de membrana en solución.

Instructor

PhD (c) César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana

Maestro en Ciencias y Estudiante de Doctorado en Química, formado en el área de biofisicoquímica. Su campo de investigación es la fisicoquímica de proteínas y el diseño racional de fármacos. Tiene experiencia en el manejo de técnicas experimentales como: Fluorescencia, espectroscopia UV-vis, Dicroísmo Circular, Calorimetría de titulación isotérmica y Dispersión Dinámica de Luz. Además de técnicas computacionales y bioinformáticas como el modelado por homología, Docking y Dinámica Molecular.

Certificado digital

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

Conocimientos básicos de bioquímica o química orgánica
Memoria RAM de 8 GB o superior.
Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

¿Debo tener algún grado académico específico para inscribirme?

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

¿Necesito tener instalado algún software antes de iniciar?

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

Si las clases en vivo ya pasaron, ¿aun así puedo tomar este curso?

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.

¿Emiten factura fiscal?

Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas