Curso de Docking molecular para moléculas complejas

Foto Dr Cesar Sanchez

PhD(c). César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana

Curso de Docking molecular para moléculas complejas

Curso en línea

Acceso durante 1 año

10 horas totales

$899.00 MXN ($45 USD)

Información general

Este curso está diseñado para investigadores que deseen aplicar el docking molecular en sus investigaciones, estudiantes que busquen ampliar sus habilidades en modelado molecular y profesionales del área químico biológica en general. Abordaremos el manejo del software más utilizado para simulaciones de docking molecular y su interpretación de resultados, abordando distintos casos que den una mejor perspectiva de su aplicación.

Qué aprenderás

Manejo de software especializado.

Visualización y análisis complejos

Ejecución de docking molecular de calidad

A quién va dirigido este curso

Este curso está dirigido a investigadores, estudiantes de posgrado y profesionales en bioquímica, biotecnología, química computacional y disciplinas afines que deseen comprender y aplicar metodologías de acoplamiento molecular en el estudio de interacciones proteína-ligando. Está diseñado tanto para principiantes que buscan una introducción teórica y práctica a las herramientas de docking como para aquellos con experiencia previa que desean optimizar sus estrategias de simulación y análisis de resultados en el diseño de fármacos, biocatálisis o biotecnología.

Beneficios del curso

Certificado de finalización

Constancia de
finalización del curso
y realización de un
proyecto con valor
curricular

Instructores expertos

Aprende directamente de expertos del área de las mejores instituciones de Latinoamérica y el mundo

Educación con proyectos

Realizarás un
proyecto académico
para demostrar las
habilidades
adquiridas en el
curso

Temario

M1 Docking molecular aplicado a la búsqueda de sitios
  • Uso del docking molecular y el flujo de trabajo del cribado virtual para la evaluación e identificación potenciales sitios de unión.
  • Selección y manejo de moléculas sonda.
  • Interpretación de resultados y selección de los sitios.
  • Uso del docking molecular para el diseño de secuencia peptídicas.

Práctica 1:  Identificación y evaluación de sitios.

Práctica 2: Diseño de secuencias peptídicas.

  • Particularidades y retos del docking Proteína-Proteína.
  • Flujo general para la ejecución de un docking entre proteínas.
  • Exploración de los servidores más utilizados para esta simulación y sus características. 

Práctica 3: Ejecución de Docking molecular proteína-proteína.

  • Análisis de las características del docking molecular proteína ácido nucleico: ventajas y desventajas
  • Flujo general de trabajo del docking proteína-ácido nucleico.
  • Preparación y obtención de moléculas de ADN y ARN.
  • Casos de aplicación de docking proteína-ácido nucleíco.

Práctica 4: Docking molecular Proteína-ADN.

Práctica 5: Docking molecular Proteína-ARN.

  • Diferencias entre el docking Proteína-Proteína y Proteína-Péptido.
  • Casos de aplicación.
  • Análisis de cómo los péptidos empiezan a sustituir paulatinamente a las moléculas orgánicas pequeñas como agentes farmacológicos.

Práctica 6: Docking Proteína-péptido.

Práctica 7: Evaluación de secuencias de péptidos diseñadas.

  • Relevancia del acoplamiento molecular en estudios científicos.
  • Aplicación del acoplamiento en la investigación y las publicaciones científicas. 
  • Exploración de compuestos químicos descubiertos o respaldados por el acoplamiento molecular en productos derivados de origen marino.

Práctica 5: Uso de los programas en publicaciones científicas.

Proyecto

Prediciendo la interacción ACE2 – Spike RBD

Utilizando el flujo de trabajo aprendido a lo largo del curso ejecutarás simulaciones de docking molecular, para predecir el complejo de interacción ACE2 – Spike RBD, relacionado a la enfermedad del SARS-CoV-2.

Instructor

Foto Dr Cesar Sanchez

PhD(c). César Sánchez Juárez

Universidad Autónoma Metropolitana

Maestro en Ciencias y Estudiante de Doctorado en Química, formado en el área de biofisicoquímica. Su campo de investigación es la fisicoquímica de proteínas y el diseño racional de fármacos. Tiene experiencia en el manejo de técnicas experimentales como: Fluorescencia, Espectroscopia UV-vis, Dicroísmo Circular, Calorimetría de titulación isotérmica y Dispersión dinámica de luz. Además de técnicas computacionales y bioinformáticas como el Modelado por homología, Docking y Dinámica Molecular.

Certificado digital

Certificado

Obtendrás un certificado con valor curricular, el cual queda registrado dentro de la plataforma de Conociverso y podrás consultar en cualquier momento para su validación.

Requerimientos técnicos

  • Conocimientos básicos de bioquímica o química orgánica
  • Memoria RAM de 8 GB o superior.
  • Procesadores core i5 similar o superior.

Preguntas frecuentes

¿Se entrega un certificado al finalizar este curso?

Sí. Al terminar el curso recibirás un certificado con valor curricular, emitido por Conociverso, que demuestra las habilidades adquiridas durante el curso.

No necesariamente. Recomendamos contar con conocimientos básicos en ciencias biológicas, pero el programa está pensado para adaptarse tanto a estudiantes como a profesionales.

No. Durante el diplomado aprenderás a instalar y utilizar cada herramienta paso a paso, con la guía de tus profesores. Únicamente necesitas contar con una computadora con al menos 8 GB de RAM.

¡Por supuesto! Todos nuestros cursos están diseñados para que también los puedas realizar en modalidad asincrónica, a tu propio ritmo y en el horario que mejor se adapte a ti. Tendrás acceso a las grabaciones de todas las clases del curso y al material complementario.


Sí, emitimos factura fiscal únicamente para México. Para solicitarla, ve a la configuración de tu cuenta, en la sección de pagos encontrarás la opción de facturación. Debe solicitarse dentro del mismo mes en que se realizó la compra.

Reseñas

M1 Optimización de resultados de Docking Molecular
  • Uso del docking molecular y el flujo de trabajo del cribado virtual para la evaluación e identificación potenciales sitios de unión.
  • Selección y manejo de moléculas sonda.
  • Interpretación de resultados y selección de los sitios.
  • Uso del docking molecular para el diseño de secuencia peptídicas.

Práctica 1:  Identificación y evaluación de sitios.

Práctica 2: Diseño de secuencias peptídicas.

  • Particularidades y retos del docking Proteína-Proteína.
  • Flujo general para la ejecución de un docking entre proteínas.
  • Exploración de los servidores más utilizados para esta simulación y sus características. 

Práctica 3: Ejecución de Docking molecular proteína-proteína.

  • Análisis de las características del docking molecular proteína ácido nucleico: ventajas y desventajas.
  • Flujo general de trabajo del docking proteína-ácido nucleico.
  • Preparación y obtención de moléculas de ADN y ARN.
  • Casos de aplicación de docking proteína-ácido nucleíco.

Práctica 4: Docking molecular Proteína-ADN.

Práctica 5: Docking molecular Proteína-ARN.

  • Diferencias entre el docking Proteína-Proteína y Proteína-Péptido.
  • Casos de aplicación.
  • Análisis de cómo los péptidos empiezan a sustituir paulatinamente a las moléculas orgánicas pequeñas como agentes farmacológicos.

Práctica 6: Docking Proteína-péptido.

Práctica 7: Evaluación de secuencias de péptidos diseñadas.

  • Estrategias más utilizadas para optimizar los resultados obtenidos en el docking de moléculas complejas.
  • Ensamble docking como estrategia para explorar la flexibilidad del receptor.

Práctica 8: Docking sencillo utilizando varias estructuras de una misma proteína.

Curso de Docking molecular para moléculas complejas

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10 horas totales

Nivel principiante

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